Por un tema administrativo y de real llegada a la gente, nuestra organización se divide en tres zonas a lo largo del país: norte, centro y sur (Nº1 Osorno y Nº2 Concepción). Dentro de las cuales los centros operacionales se encuentran en Santiago, Rancagua, Concepción y Osorno. Cada zona tiene su coordinador/a encargada/o de posicionar la temática trans en su zona y dar respuesta a las personas que se acerquen a nuestra organización.
Zona Norte: I Región de Tarapacá, II Región de Antofagasta, III Región de Atacama, IV Región de Coquimbo, V Región de Valparaíso, y XV Región Metropolitana
Zona Centro: VI Región del Libertador Bernardo O`higgins y VII Región del Maule
Zona Sur :esta dividida en dos, zona 1 y zona 2, ya que es de mayor complejidad y extensión territorial.
Zona Osorno: VIII Región del Bío Bío, IX Región de la Araucanía
Zona Concepción: X Región de los Lagos, XI Región de Aysén del General Carlos Ibáñez del Campo, XII Región de Magallanes y la Antártica Chilena
Zona Osorno: francofuica@transexualesdechile.org
Zona Concepción: laurajerez@transexualesdechile.org
Area TransFemenina: victoriaandrea@transexualesdechile.org
Zona Norte: michelriquelme@transexualesdechile.org
Zona Centro: andresrivera@transexualesdechile.org , otdcontacto@transexualesdechile.org